我如何追回无直接转账记录的借款？

根据您提供的情况，处理资金借贷纠纷时，证据的充分性是关键。您与借款人之间虽然缺少直接的转账记录，但其他相关证据，如你们合作开店的证明、店铺账本记录、对方已还款的记录等，都可以作为借贷关系的间接证明。您应尽快整理所有可用证据，准备向法院提起诉讼。考虑到对方已还款部分借款，这有助于支持您的借款主张。

您可以向当地人民法院提交诉讼请求，要求对方归还剩余的款项。在此过程中，如果存在任何书面协议或借条，将大大增加您胜诉的概率。若没有，日常的交流记录、共同经营的证据等也可作为有力证明。

此外，由于您的资金系通过借贷获得，若有该借贷合同，应一并准备，以证明您的资金来源的合法性及急迫性。建议尽早行动，以免因时间过长而影响证据的搜集或有效性。恢复资金的过程可能会有些复杂和漫长，但法律将提供必要的保护和支持。