工资被克扣怎么办？

根据您提供的情况，您与老板约定的保底工资与实际发放不符，且存在不合理扣款。这涉嫌违反《劳动合同法》关于工资支付的强制性规定。针对您咨询的劳动纠纷问题，您有权要求用人单位足额支付约定的保底工资，并返还违法扣除的款项。首先，您需要收集并整理好所有能证明双方约定内容的证据，例如微信聊天记录、短信、录音或证人证言等，这些是证明存在4000元保底工资约定的关键。同时，保存好您的考勤记录、工资条以及老板单方面变更计算方式的任何通知或沟通记录。

其次，根据《劳动合同法》第八十五条，用人单位未及时足额支付劳动报酬的，由劳动行政部门责令限期支付；逾期不支付的，责令用人单位按应付金额百分之五十以上百分之一百以下的标准向您加付赔偿金。您当前的差额加上违法扣款，总额已明显超出4000元，您的诉求具有充分的法律依据。

您可以立即采取的行动是，向用人单位所在地，即浙江省金华市永康市的劳动监察大队进行投诉举报，这是最快捷的行政维权途径。在投诉时，提交您准备好的全部证据，清晰说明约定的保底工资、实际工作天数、被扣除的款项及金额。劳动监察部门会介入调查并责令单位纠正。如果行政途径无法解决，您可以向永康市劳动人事争议仲裁委员会申请仲裁，这是诉讼前的必经程序。请注意，劳动仲裁的时效为一年，从您知道权利被侵害之日（即发薪日）起算，请务必及时行动以保障您的工资权益。