如果我发了工资会有影响吗？

根据您提供的情况，变卖由法院发布保全公告的机器，涉及法律关系复杂。首先，根据我国的法律规定，一旦财产被法院进行司法保全，该财产处置必须得到法院的同意。您描述的代表人未经法院许可便处分了这些机器，可能已违反了相关法律规定，性质较为严重。

您当前面临的主要问题是处理这笔资金是否合法及是否会对您个人产生法律责任。由于资金来源于可能违法的财产处置，如果您用这笔钱支付工资，可能会被认定为参与了违法行为。这不仅可能影响到您发放工资的合法性，还可能涉及到违法所得的问题，对您个人的法律责任产生影响。

建议您立即停止使用这笔资金，并主动联系有关部门（如法院或者当地的司法行政机关）说明情况并寻求指导。您可以通过合法途径来确认这笔资金的合法性，如向法院申请相应的处理决定。同时，关于工资发放问题，建议您同工人代表商讨，寻求其他合法途径解决工资问题，以确保您的行为不会触法。

在这种情况下，不仅要确保员工权益的同时，也应保护自己不受法律责任的牵连，通过合法途径解决现存问题是最佳选择。