如何理解“取保候审”和防止自身权益受损？

根据您提供的情况，首先，您作为公司的员工，是否涉及违法行为取决于您是否知情及参与了这些违法活动。如果您没有直接参与或知情，一般不会构成犯罪。更多信息，引导您理解您的法律地位和责任。

关于警方的办案流程，确保所有行为都需要严格依法办理。取保候审的程序中，要求缴纳保证金本身是符合法律规范的，但如果警方行为存在强制性错误或违法，例如不当扣押个人财务等，您可以申请法律救助。针对您的具体案件，建议您保留好所有与案件相关的文件和交流记录。

如果您未去资阳录制口供就被标记为“在逃”，这可能存在法律上的争议。根据《中华人民共和国刑事诉讼法》，嫌疑人和被告人都有权利得到法律援助和公平对待。您可以要求警方提供正式的通知，并咨询法律意见来确定是否有必要前往。

此外，关于您的手机被扣押问题，通常情况下，如果手机中含有调查所需的证据，警方可能会暂时扣押。但这需要有明确的法律程序和合理的理由，否则您有权要求返还。

在此情况下，我建议您继续保持与警方的合作，并寻求具体的法律咨询以了解更详尽的责任和权利。务必保证个人安全和合法权益不受侵犯，保持沉着应对，并及时记录所有相关事件，以备不时之需。