孩子抚养费如何保证？

根据您提供的情况，分居已超三年，并希望对方承担抚养费，在中国大陆的婚姻法中，分居满两年即可认定丧失夫妻感情，构成起诉离婚的法定理由。您可以直接向法院申请离婚，并请求对方承担孩子的抚养费。

首先，您需要收集证据证明长期分居的事实，如租房合同、居住证明等。其次，因为对方失联，您需要通过法院进行公告送达程序，即在法院判定适当的公告期后，如果对方仍未出现，法院将默认您的起诉请求。此外，您应详细说明孩子抚养费的需求，包括日常生活费用、教育费用等。

由于您是孩子的实际抚养人，一般法院会支持您关于抚养费的请求。同时，您可要求对方一次性或分期支付抚养费，确保孩子正常成长的经济支持。

在起诉文件中，您需要明确列出您的诉求，包括离婚和孩子的抚养费用，并提供必要的证明材料。建议您在提交起诉前，详细了解相关法律规定，准备齐全的证据，以保护您和您孩子的权益。