公司私自扣减工资怎么办？

根据您提供的情况，您有权要求公司补发被克扣的薪资差额，公司单方变更薪资结构属违法行为。

针对您咨询的劳动纠纷问题，公司未经协商擅自扣除热玛吉耗材成本并调整薪资结构，违反了《劳动合同法》第35条关于变更劳动合同需双方协商一致的规定。您有权要求公司补发被克扣的薪资差额，并可主张经济补偿。

具体维权建议如下：
1. **收集证据**：保留工资流水、劳动合同、业绩记录等，证明公司未按约定发放薪资。
2. **协商解决**：先与公司沟通，要求补发差额，若公司拒绝，可向劳动监察部门投诉。
3. **申请劳动仲裁**：若协商无果，可在离职后一年内向浦东新区劳动人事争议仲裁委员会提交仲裁申请，要求公司支付欠薪及可能的赔偿金。

公司擅自扣减薪资的行为已构成违约，您完全可以通过法律途径维护自身权益。