如何追回过多扣除的房租？

根据您提供的情况，违约金条款需要符合《合同法》的合理性原则。租房公司应退还超额收取的金额。根据《合同法》第一百一十四条，违约金的设定应当公平合理，不得过高设定。租客有权要求退还不合理部分的违约金或者过度收取的费用。

在您的情况下，首先应确认合同中关于退房与违约金的具体条款，检查其是否合理。如果发现违约金的比例明显高于正常水平，或超出了对方可能遭受的损失，可以向有关部门投诉或提起诉讼。

建议首先与租赁公司进行沟通，请求退还适当的房费。如果协调不成，可向消费者协会投诉或直接向人民法院提起诉讼，请求判决确认违约金条款无效，并要求返还多收的房费。在诉讼过程中，可以提交房租合同、支付证明等相关证据，以支持您的诉求。