被扣工资1000元怎么办？

根据您提供的情况，您被辞退后遭扣工资涉嫌违法，可申请劳动仲裁追讨。用人单位以旷工为由扣减工资需举证，否则属克扣工资行为。

针对您咨询的劳动纠纷问题，我为您分析如下：

1. 法律依据
根据《劳动合同法》第30条和第85条规定，用人单位应按约定支付劳动报酬，不得克扣或无故拖欠工资。用人单位主张您旷工需提供充分证据，否则扣减工资行为违法。

2. 维权建议
(1) 立即收集证据：包括劳动合同、考勤记录、工资条等
(2) 向昆山市劳动监察大队投诉
(3) 申请劳动仲裁，要求支付被扣工资及赔偿金

3. 注意事项
劳动仲裁时效为1年，建议尽快处理。即使您已签字，只要签字时存在重大误解或显失公平，仍可主张权利。

4. 行动步骤
建议您先与用人单位协商，协商不成再走法律程序。1000元标的额虽小，但维权过程可能产生其他费用，需权衡利弊。

如需进一步指导，可付费咨询具体证据收集和仲裁程序细节。