怎么处理病假期间被误认为旷工的劳动纠纷？

针对您咨询的劳动纠纷问题，雇主将您的请病假视为旷工并宣称自动离职，这需要详细审查相关证据及法律条款。根据《中华人民共和国劳动合同法》，在法定病假期间，雇主不得解除劳动合同。您持有的医院诊断证明和微信请假记录均为重要证据，有助于证明您的请假是合法且有理据的。

首先，您需要确认所有请病假的证明（包括诊所的病历记录）已经提交给雇主，并明确进行解释，以免误解。其次，您的请假记录，尤其是与雇主通过微信进行的请假沟通，可以作为证据展示您并未无故旷工。如果雇主坚持以自动离职处理，这可能构成了非法解雇。

您可以要求雇主按照非法解雇处理此事，并为您提供应有的经济补偿。如果雇主不同意，您可以向当地劳动监察大队投诉，或直接向人民法院提起劳动争议诉讼。在申请过程中，确保所有相关证据被妥善保存和提交，这包括医院和诊所的病历记录、与雇主的沟通记录等。

总之，根据您提供的情境，若雇主在没有合法依据的情况下宣称您自动离职，这是不符合中国劳动法的规定的，您有权要求适当的法律补偿。