公司以物品缺失为由扣工资怎么办？

根据您提供的情况，您已正式辞职但公司以物品缺失为由扣发工资4000元，这涉嫌违法扣薪。依据《劳动合同法》第50条，用人单位应在解除劳动合同时出具证明并结清工资。

针对物品缺失的争议，公司必须提供充分证据证明您存在过错，否则无权扣减工资。您可立即采取以下维权措施：
1. 书面要求公司出具书面扣薪依据
2. 收集工资流水、劳动合同等证据
3. 向东莞劳动仲裁委员会申请仲裁

特别提醒：根据《工资支付暂行规定》第16条，因劳动者原因造成经济损失的，每月扣除部分不得超过当月工资20%。公司要求全额赔偿4000元明显违法。

建议您尽快启动仲裁程序，仲裁时效为一年。劳动仲裁不收取费用，胜诉后还可主张50%-100%的赔偿金。如需具体操作指导，可继续查看完整回复。