公司扣我三倍工资怎么办？

根据您提供的情况，公司以考勤异常为由扣除三倍日薪的做法缺乏法律依据，涉嫌违法克扣工资。您可以立即采取行动维权，要求返还多扣款项并可能主张赔偿金。

依据《中华人民共和国劳动合同法》及相关规定，用人单位对劳动者进行经济处罚必须依法依规，且罚款金额不得超过劳动者当月工资的百分之二十。您所述的“扣除当天工资的三倍”这一内部规定，因其处罚标准畸高，极有可能被认定为无效的规章制度。您通过微信向管理员请假的事实，构成了履行请假义务的初步证据，即使钉钉流程未完成，也不能直接等同于无故旷工。

因此，公司的扣款行为涉嫌违法克扣劳动报酬。您的核心维权途径如下：首先，务必整理并保存好所有证据，包括劳动合同、工资银行流水、记载请假沟通内容的微信聊天记录截图、能证明扣款事实的工资条或通知等。其次，向公司正式发出书面函告（建议使用快递邮寄并保留凭证），明确指出其扣款行为违法，要求其在限期内返还多扣的薪资。若公司拒绝，您应立即向用人单位所在地（即昆明市石林县）的劳动监察大队进行投诉举报，或直接向石林县劳动人事争议仲裁委员会申请仲裁，主张返还被违法克扣的900元工资。鉴于金额明确、事实清晰，通过行政投诉或劳动仲裁解决此事的效率较高。