合作协议影响工资讨回怎么办？

根据您提供的情况，合作协议可能被用以规避劳动关系，这直接影响您维权。依据《关于确立劳动关系有关事项的通知》，即便未签劳动合同，只要符合用工管理事实，即可认定劳动关系。您需重点收集能证明接受公司管理、从事有偿劳动的证据，例如考勤、工作沟通记录、证人证言等，以反驳合作协议的效力。劳动仲裁中，证明存在事实劳动关系是索回工资的关键第一步。针对合作协议，您可以主张其内容若实质为劳动管理，则属以合法形式掩盖非法目的，应为无效。请尽快系统整理所有证据材料，向松桃苗族自治县劳动人事争议仲裁委员会正式提交申请，主张支付被拖欠的工资2000元。